В сентябре 1948 года приветливо распахнула свои двери самая первая школа поселка Черноморского, с радостью принявшая первых учеников в свои стены. Это стало не просто большим, а знаменательным событием для жителей поселка.  Первоначально школа была семилетней, затем она стала «восьмилеткой», а с 1955 года школа стала именоваться средним общеобразовательным учреждением.
Первоначально школа работала в две смены. Наполняемость классов была до 50 учеников; всего было 19 классов.

Первым директором школы был Семен Иванович Полешко. Затем школу возглавил Василий Алексеевич Ушаков, и на этом посту его в последующем сменил Анатолий Анатольевич Нипиющий, проработавший здесь 33 года. Последующие  директора, руководили школой, но недолго: Чапля Оксана Александровна (2 года); Юрченко Сергей Викторович (2 года); Левина Светлана Анатольевна (6 мес); Юник Оксана Анатольевна (4 года). В настоящее время школу возглавляет  Корниенко Анна Алексеевна.

На сегодняшний день в школе работает профессиональный творческий коллектив из 16 педагогов, продолжающий и развивающий первоначальные традиции. С гордостью говорим, что за достойный труд и высокие профессиональные показатели ряд учителей школы отмечен грамотами Управления образования МО Северский район: Филимоненко Ирина Валерьевна -  учитель физики и математики; Китаева Валентина Георгиевна - учитель биологии, и грамотой Министерства образования и науки Краснодарского края - Авдышева Татьяна Николаевна, учитель математики. А также важно отметить, что за многолетний труд и за заслуги в области образования в 2007 году Китаева Валентина Георгиевна награждена нагрудным знаком «Почетный работник общего образования Российской Федерации». Плеяде учителей есть на кого равняться и есть кому перенимать эстафету: достижения многих педагогов отмечены грамотами и похвальными листами.

За период с 1948 по 2015 год стены школы покинули 60 выпускных классов,  что составило 2205 учащихся:  49 из них были награждены  золотыми медалями, 62 - серебряными, 102 ученикам вручены Похвальные грамоты за отличные показатели в учебе. В 2015-2016 учебном году 5 выпускников школы претендуют на золотые медали. Отличные результаты учащихся - это, фактически, показатель работы не только учеников, но и школы на протяжении всех лет.

В процессе учебы наши ученики принимают активное участие в различного рода олимпиадах, конкурсах, и спортивных мероприятиях, где показывают высокие результаты. Самое активное участие они принимают в военно-патриотической работе, в школе имеются отряды «Юных Жуковцев». Частыми гостями школы являются ветераны Великой Отечественной войны, заслуженные люди поселка, и встречи эти одинаково важны для всех участников мероприятий. С большим воодушевлением ребята принимают участие в военно-патриотических сборах и соревнованиях.

Учащиеся школы ведут здоровый образ жизни, и показатели говорят сами за себя: в копилку школы привнесено большое количество грамот и наград. Школе есть чем гордиться!

Образовательное учреждение имеет благоприятное географическое расположение, что влияет на очень тесное взаимодействие с  Домом культуры, школой искусств, ЦРТДЮ, ДЮСША № 3,  СК «Черноморец»; в непосредственной близости находится поселковая библиотека, что дает возможность для довольно плодотворного взаимосотрудничества и обогащения. Учащиеся школы с удовольствием посещают кружки и занятия в данных учреждениях.

На сегодняшний день в МБОУ СОШ № 21 обучается 268 учащихся. Школа работает в одну смену; все кабинеты оснащены современным оборудованием, в классах установлены интерактивные доски, проекторы, компьютеры. В 2014 году в школе сделан капитальный ремонт спортивного зала, на очереди стоит серьёзный ремонт фасада школы.